创建基础、师资力量、发展历史、收费标准、办学层次等都是不同的。独立学院的创建是根据教育部的行政规章；而民办学校的创办者是根据民办教育促进法。
一：办学性质
民办高校是按照民办教育促进法设立的，而独立学院是教育部行政规章设立的。
二：学费
独立学院的学费，每年在10000元以上。
民办高校的学费在10000元——20000元不等。
三：学历层次
独立学院多为民办本科，少部分独立学院也可以招收专科专业。
民办学院专科和本科都很常见。
四：师资资源
民办就是有自己的校名，自己组织机构，自己的师资。
独立学院一般设在某个大学名下，可能和挂名的大学同在一个校园，也可能有师资等方面的共享和交流。